Il Programma Annuale è il principale documento contabile delle scuole.
Nel Programma Annuale sono indicate tutte le entrate, aggregate secondo la loro provenienza nonché gli stanziamenti di spesa aggregati per le esigenze del funzionamento amministrativo e didattico generale, per i compensi spettanti al personale dipendente per effetto di norme contrattuali e/o di disposizioni di legge, per le spese di investimento e per i singoli progetti da realizzare.
Tutte le entrate vengono utilizzate senza altro vincolo di destinazione se non quello della realizzazione del Piano dell'Offerta Formativa.